背負人類命運的女帝「維絲塔」，帶領著眾人，創建了新的愛斯嘉王朝。雖然戰爭結束了，但野心卻無時無刻存在著！深知這點的女帝，依然不忘充實軍備，而提升軍力的工作，就落在妹妹「妮雅」身上了。

　　「妮雅」將自身經驗盡數傳授部下，只求人人能夠保家衛國，並非徒增傷亡，部下們也都全力配合，自我鍛鍊。平安的日子過去了，可怕的陰謀卻緊接而來，籠罩著愛斯嘉大陸.......

　　「妮雅」快步衝進大殿，看見「希蜜」與瓦爾克麗的衛士和騎士團堡的騎兵激戰當中，「妮雅」當即加入戰局之中！

　　擊退敵軍後，「妮雅」請「希蜜」緊急集合所有的高級將領，在內殿召開緊急會議。「蒙欣曼」表示從俘虜的敵軍中，問出挾持女帝的人竟是「萊茵」和「汀塔琪」，想必是被帶到騎士團堡去了，所以必須立刻趕過去，將女帝救出來。

　　「妮雅」率領第一軍團，經過長途跋涉，終於來到騎士團堡前，準備攻入騎士團堡，救出女帝！

　　戰後、就在「妮雅」等人準備進入騎士團堡時，一位「黛西」率領的第四軍團士兵緊急來報，說第四軍團中了騎士團的埋伏，現在已被包圍了，所以「黛西」團長緊急派他來向「妮雅」殿下求援。「妮雅」派「希蜜」和「拉朵那」率兵前去支援。

　　在「希蜜」等人啟程援救第四軍團後，「妮雅」決定繼續向騎士團堡推進.......

　　將敵人全數殲滅後，「妮雅」下令軍隊就地休息，順便等待其他軍團前來會合。

　　「希蜜」和「拉朵那」等人在求救士兵的帶領下，來到第四軍團被圍攻之處，發現第四軍團正陷入苦戰，當即上前救援.....

　　由於「希蜜」等人的幫助，終於成功的解除第四軍團的困境。當「希蜜」等人回到騎士團堡時，其餘三路軍團已經在此地守候著，待所有人都會合完後，「妮雅」便率領部隊，進入騎士團堡。

　　但「蒙欣曼」卻在城門外發現一件奇怪的事，為何都沒人出來阻擋她們入城？「葛蒂拉斯」表示感覺到城內有一絲詭異氣體正不安的流動著，懷疑有人在此施了法術。為求小心、「蒙欣曼」命弓兵朝城門射箭，果不其然、城內傳出震耳的爆炸聲響。當爆炸聲漸漸遠去，眾人都為自己的遲疑暗自慶幸。

　　「葛蒂拉斯」說此種的法術程度，對她來說應還能應付得來，請「妮雅」在部隊中挑選幾人，她準備張設一道結界，讓這些人在結界內來穿過力場。

　　此戰我方人員須在「葛蒂拉斯」二格範圍內，緩緩前進吧！如此才不會受到力場的傷害。

　　順利通過力場到內殿，發現大批騎士團精銳部隊，以及挾持女帝的「萊茵」和「汀塔淇」。她們姐妹倆轉身向周圍的部隊使了一個眼色，身懷敵意的部隊開始向「妮雅」等人逼進，大戰一觸即發！

　　戰後、「汀塔淇」和「萊茵」恢復神智，得知可能是「琴斯」所施法術，讓她倆失去意識而遭到控制。

　　在「汀塔淇」和「萊茵」的帶領下，來到「琴斯」的寢室，發現「琴斯」正帶著女帝準備通過身後的魔法陣。「葛蒂拉斯」看出魔法陣正是異世界之門，情急之下以法術攻擊「琴斯」，但「琴斯」也不甘示弱的施展防禦術，並趁隙將女帝帶入異世界之門......

　　當「妮雅」等人依照「葛蒂拉斯」的指示，通過了異世界之門來到異世界，遭遇到大批軍隊以極快的速度來到。她們認為「妮雅」等人是敵人，不由分說就進擊而來！

　　戰後、另一批遊騎兵出現，敵將領「西艾蕾」見狀下令撤退而去。「妮雅」等人發現剛才作戰的敵人，很像是以前的拉那洛族人，但那是古時候的人，怎麼出現在此而令人感到納悶！

　　此時另一批遊騎兵的騎兵前來瞭解原因，「希蜜」將愛斯嘉大陸的女帝被擄之事告知，但對方卻不知愛斯嘉大陸及女帝之事！因見「妮雅」等人幫忙打退敵人，遂答應帶眾人前去見她們的首領。

　　「妮雅」等人隨著遊騎兵部隊，來到營地見到她們的首領「蘇蘭達」。她雖相信眾人所說的異世界之門的事，但卻無法幫助眾人，因為她不想將「妮雅」等人捲入她們的戰爭之中。

　　原來長久以來，她們遊騎兵一直和死亡之谷的人對抗，連什麼時候會喪命都無法預料，所以無餘力來幫助眾人。為保眾人的安全，只能讓眾人留宿一宿，等天一亮就得離開。

　　「蘇蘭達」表明立場後，「妮雅」也不再強求，只好先休息一晚，待明天再另謀對策。當晚，「妮雅」等人留在營地休息時，敵人前來偷襲營地周圍的部隊，「妮雅」等人決定助「蘇蘭達」退敵！

　　「妮雅」等人幫助擊退來襲的敵軍，使得遊騎兵仍能保留住大部份的戰力。「蘇蘭達」回到營地後，也開始對自己過於冷淡的態度感到十分內疚而向「妮雅」致歉，決定盡全力幫助「妮雅」找到女帝。

　　當「蘇蘭達」決定幫助「妮雅」之後，便連夜和「妮雅」等人討論「琴斯」可能的去處，直至清晨......

　　此時龍塔的半龍戰士前來偷襲，但敵人在天空難以對付。「蘇蘭達」表示有飛船可助脫險，但飛船的藏匿地點離此處有一段距離。因此由她們來引開半龍戰士，請「多莉」帶「妮雅」等人前去取船。

　　計劃一開始，「蘇蘭達」便指揮遊騎兵引誘敵人注意，好讓「妮雅」等人趁機離開營地。接著、遊騎兵和敵人之間的纏鬥就此展開......

　　「蘇蘭達」擊退敵人後，另方面、「妮雅」在「多莉」帶領下前往飛船地點，途中遭遇敵襲........

　　順利護送「多莉」到達右上飛船處，眾人登上飛船，在「多莉」的啟動飛行返回營地時，發現「蘇蘭達」等人陷入苦戰，眾人展開救援行動！

　　順利救援「蘇蘭達」登上飛船後，即刻飛行逃離。「蘇蘭達」表示龍塔的半龍戰士向來不問世事，為何會無緣無故攻擊眾人，「妮雅」說他們也許已和死亡之谷結盟才會如此！「蘇蘭達」言道龍塔也曾受過死亡之谷的壓迫，直至幾年前才脫離它們的控制，所以不可能再和它們結盟。

　　這些種種的疑惑，讓「妮雅」和「希蜜」聯想到「琴斯」，也許是「琴斯」所為才會如此。眾人為解疑惑，決定前往龍塔查明真相。此時半龍戰士從後緊追而來，眾人展開退敵之戰！

　　戰後、飛船繼續朝龍塔方向飛行，途中卻遭到妖龍怪物的猛力衝撞。不消一會，破裂的船身已經冒出黑色濃煙，墜落到沼澤之中，並遭到一群水戰士的襲擊......

　　打倒水戰士並將他們俘虜後，「葛蒂拉斯」用魔法將他們馴服，以幫助我軍作戰。

　　離開沼澤之後，「妮雅」等人發現前方高聳入雲的龍塔。「蘇蘭達」表示要到達龍塔，只有一條路能走，但一路上還有各種可怕的敵人等著大家，而且天又快黑了，因此決定加快腳步快速衝過，即可給她們來個措手不及，並可避免敵人在黑夜裡偷襲！

　　擊退敵軍，進入龍塔後，「蘇蘭達」表示龍塔的主人龍王就在塔頂，眾人決定開始朝塔頂進攻.......

　　在歷經眾多守衛的攔阻下，仍能一次次化解危機的「妮雅」，終於率領眾人來到塔頂。進入後、發現大量的敵兵！此時龍塔的守護者走向眾人，說得知眾人是從另一個世界過來，要毀滅她們龍塔！「妮雅」急忙解釋說只是來這裡尋找女帝，並沒有要毀滅龍塔。守護者得悉後，言道這一切或許是她們的使者有意隱瞞。

　　因為在不久之前，她們的人民還過著與世隔絕的和平生活，突然有一群人從另一個世界來到這裡，破壞她們寧靜的生活。並以法術將她們的統治者龍王石化，然後揚長而去！兩天之後、死亡之谷派來使者，告訴她們這些從另一個世界來的人，將與遊騎兵勾結，準備摧毀死亡之谷和龍塔，並且佔據這個世界。所以她才會命令所有半龍戰士尋找並消滅眾人！

　　「妮雅」表示對這個世界並無任何野心，這一切應是死亡之谷的陰謀。遭石化的龍王，應只有「琴斯」能化解，而「琴斯」應就是與死亡之谷勾結的人，眾人決定前往死亡之谷一探究竟！

　　此時妖龍使者出現要消滅眾人，「希蜜」發現牠正是將飛船撞落的怪物，大戰一觸即發！

　　戰後、正當妖龍氣力用盡，疲弱不堪時，「琴斯」突然現身在大家面前，妖龍趁機逃離而去！「妮雅」質問「琴斯」為何擄走女帝，「琴斯」表示現在還不能說，再過不久真相就會大白了。

　　「琴斯」施法解開龍王的石化之後，對「葛蒂拉斯」說從以前就一直在監視她的行動，今後也是一樣，所以最好不要露出馬腳，語畢便即離去！「妮雅」等人不明「琴斯」所言之意。

　　龍王甦醒後，表示在被石化期間，牠的意識和感覺仍然存在，也因此能夠知道龍塔裡的一切事物。因此向「妮雅」致歉，並說龍塔戰士將無條件幫助「妮雅」，直到她完成在這個世界所要完成的事。

　　龍王認為「琴斯」並非壞人，因此向「妮雅」告知「琴斯」的位置，希望「妮雅」能圓滿解決彼此間的問題。翌日、守護者施法將「妮雅」一行人傳送到「琴斯」所在地點。

　　「妮雅」等人張開眼睛後，發現被傳送到焦林森林當中，不遠處有個村落。當「妮雅」找齊人手正在搜索村莊時，「琴斯」帶著女帝「維絲塔」從屋內出來，並說明發生的一切因由～

　　昔日在兩族合併時，從拉那洛城裡找到閃著紅光的魔法卷軸。當時拉那洛主教「堤爾莉」發現一種奇特的法術，能夠將世界和另外一個世界連接起來，也可傳送兩個世界上的所有東西。

　　當時看到卷軸上的說明文，居然發現了一樁非常可怕的陰謀。當「堤爾莉」可以自由運用此魔法後，便立刻將一批人送到異世界中，企圖尋找合作對象，進而幫助拉那洛打敗瓦爾克麗。

　　不過這批人一去就失去了音訊，直至拉那洛戰敗都未曾出現過。在經過調查後，發現這批人已經和死亡之谷的魔女「碧娜維姬」建立了關係，準備利用法術控制女帝，讓她放棄抵抗拉那洛，並無條件交出帝位。那時雖拼命想辦法阻止這批人行動，卻忽略女帝身旁的「葛蒂拉斯」！

　　為了不讓「葛蒂拉斯」傷害到女帝，所以才先一步帶走女帝，並利用異世界之門送到這個世界，等待危機過後再通知大家。

　　「葛蒂拉斯」見身份已敗露，喚出妖龍要消滅眾人，大戰一觸即發！

　　戰後、一行人離開焦土森林，沿路前進來到死亡之谷，遭遇到大批敵兵的阻攔，全力攻擊前進吧！

　　攻進城堡見到「碧娜維姬」。「琴斯」表示在「碧娜維姬」身上有一邊神秘的魔法，若是將這道魔法釋出的話，足以將這座城堡夷為平地！但這道魔法仍有弱點，只要將魔法咒語反過來唸，即可封住這道魔法了！「碧娜維姬」見魔法被「琴斯」破解，氣怒的攻擊而來！

　　打倒「碧娜維姬」之後，「蘇蘭達」表示她已不再有害了，遂放她一馬。女帝「維絲塔」向「碧娜維姬」詢問祭壇上閃著黑色亮光水晶之事，她說該水晶叫做黑魔石，是用來支撐這個世界和其它各個世界的重要接點，只要黑魔石一毀，這個世界就會恢復成一個獨立世界，再也無法和其它世界相連了！

　　「碧娜維姬」表示那批拉那洛人早已回到原來的世界，想必已去攻打瓦爾克麗城了！「妮雅」聽後、請「琴斯」趕緊打開異世界之門，將眾人送回瓦爾克麗城。「蘇蘭達」和龍塔的人表示雖不是那個世界的人，但願意一同前往幫助「妮雅」解決危城之急！

　　回到瓦爾克麗城外，發現敵軍已在攻城，當即上前解救危城囉！

　　戰後、城內戰士說在「妮雅」一行人進入異世界之後，這裡來了一批來路不明的人，暗中煽動拉那洛族人叛變，更趁女帝不在時進入瓦爾克麗城。幸好「妮雅」及女帝及時回來，化解了瓦爾克麗的危機。

　　暫時得到勝利的瓦爾克麗軍，在「萊茵」和「汀塔琪」兩人的指揮下，重新進行整備。而剛歸來的女帝及「妮雅」等人，立刻在大殿內商議接下來的對策。

　　之後、敵軍包圍瓦爾克麗城準備衝進來，「妮雅」通知城內的人，開始迎戰！

　　「妮雅」等人成功的突破了敵方所設下的包圍圈，稍稍的疏解了瓦爾克麗城內外的緊張情勢。此時「黛西」來報說查出拉那洛叛軍指揮官四騎士的底細，目前第一個人「艾西柯羅」守在騎士團堡中，其他三人「芙瑪羅妮」、「蕾娜吉芙」及「菲伊魯茵」則駐防在斯德林海峽一帶。

　　「妮雅」表示要收回被攻陷的騎士團堡，也藉此來會會這個叫「艾西柯羅」的人！之後率領瓦爾克麗軍，將戰場推進至騎士團堡，正式對上「艾西柯羅」！

　　收復騎士團堡後，「妮雅」等人便忙著策劃反攻拉那洛城的計劃。此時瓦爾克麗城傳令士兵來報說女帝發狂了！「琴斯」當即想到一定是「碧娜維姬」的魔法所致。

　　「妮雅」決定和「琴斯」回城查探，命「希蜜」和「蘇蘭達」留下指揮，將兵力先佈署在斯德林海峽一帶，等女帝病情穩定就趕回來續攻。

　　回到城內看見女帝開始發狂，「琴斯」請祭司拿女帝的權杖給「妮雅」。言道女帝的權杖又名淚之杖，傳說是由水神眼淚所凝聚而成，能淨化人內心的一切慾望。現在女帝的心智已經混亂，只有淚之杖才能救得了她！

　　成功讓女帝恢復正常之後，「妮雅」與「琴斯」趕回騎士團堡與「希蜜」等人會合。「蘇蘭達」表示已查出四騎士之一「菲伊魯茵」的部隊位置。「妮雅」當即率隊橫渡斯德林海峽，卻遭到「菲伊魯茵」的埋伏，大戰一觸即發！

　　「菲伊魯茵」落敗撤退而去。「妮雅」一行人趁勝追擊到城內，遭遇到四騎士之一的「芙瑪羅妮」前來支援「菲伊魯茵」！

　　解決四騎士中的兩個之後，繼續推進到拉那洛城，展開攻城戰！

　　攻進城內見到最後一位四騎士「蕾娜吉芙」，激戰再起！

　　消滅敵人後，發現城內竟有異世界之門，眾人臆測是「碧娜維姬」的力量復原所為！且一批死亡之谷的士兵從裡面衝了出來，向眾人攻擊而來！

　　戰後、發現這些士兵不像是要作戰，倒像是在逃難，莫非異世界發生了什麼事！眾人決定前往查看！

　　一到異世界城堡內，驚見始作俑者竟是「碧娜維姬」。她表示自己除了擁有強大的法力外，還能吸收其它物體的力量。當時被眾人打敗奄奄一息時，最靠近她的就是黑魔石。也因吸收了黑魔石的力量，所以能自由的移動到任何一個世界，繼續占領所有世界的行動！

　　妮雅等人為阻止她的野心，群起對戰「碧娜維姬」！

　　「碧娜維姬」落敗後，又開始吸收周圍自己部下的力量，再次壯大地攻擊而來！

　　終於消滅「碧娜維姬」，贏得了最後的勝利！龍塔的戰士們也回到自己的世界，「蘇蘭達」說遊騎兵一向是居無定所，而且最大宿敵「碧娜維姬」也已經死亡，所以決定跟隨「妮雅」在這個世界生活......

　　為了慶祝瓦爾克麗又一次的勝利，女帝便在城門外，興建了一座戰士雕像。但雕像的身份無人知曉.......

　　突然、眾人的身後發出了無數詭異的笑聲，曾經被妮雅一行人打敗的人，不甘心地利用異世界之門回到這裡復仇，大戰一觸即發！

　　和煦的陽光，投射在靜肅的王室墓園中。女帝和「妮雅」帶領著所有人來到瑪姬的墓前，一如往常，女帝將雙手中的鮮花，放在灰白色的墓碑前。然後輕聲唸著碑文： 「.....身著銀色鎧甲、手持尖銳利劍、英勇無比的戰士，長眠.........」，突然女帝改口斥喝 「哼！全都給我死在這裡，永遠都不要再出來了！」

　　.................就這樣.............世界和平了............！？